Prečo je NGS lepší ako Sanger?
Prečo je NGS lepší ako Sanger?

Video: Prečo je NGS lepší ako Sanger?

Video: Prečo je NGS lepší ako Sanger?
Video: 22.02.2022 зеркальная дата, поворотный момент в судьбе каждого из нас, 22 февраля, день шести двоек 2024, November
Anonim

Veľkosť vzorky

NGS je výrazne lacnejší, rýchlejší, potrebuje podstatne menej DNA a je viac presné a spoľahlivé než Sanger sekvenovanie. Pozrime sa na to viac tesne. Pre Sanger pri sekvenovaní je na každé čítanie potrebné veľké množstvo templátovej DNA

Ľudia sa tiež pýtajú, aké sú výhody sekvenovania ďalšej generácie?

Každý má špecifické výhody pre kritériá: dĺžka čítania, presnosť, doba chodu a priepustnosť. Okrem analýzy sekvencií DNA, progresie sekvenovanie Výsledkom týchto technológií je analýza ďalších biologických zložiek, ako je RNA a proteín, ako aj ich interakcie v zložitých bunkových sieťach.

Možno sa tiež opýtať, prečo sa stále používa Sangerovo sekvenovanie? Sangerove sekvenovanie rokmi zlepšoval, z veľkej časti vďaka automatizácii, a bol základom pre sekvenovanie prvý ľudský genóm v roku 2000. Za menej ako dve desaťročia však NGS predbehla Sangerove sekvenovanie vďaka vysokej priepustnosti, paralelnej prevádzke a oveľa nižším nákladom na jednu základňu.

Aký je teda rozdiel medzi Sangerovým sekvenovaním a sekvenovaním novej generácie?

Každý inkorporovaný nukleotid je identifikovaný svojou fluorescenčnou značkou. Kritické rozdiel medzi Sangersekvenovaním a NGS je sekvenovanie objem. Kým Sanger iba metódou sekvencie jeden fragment DNA v čase, NGS je masívne paralelný, sekvenovanie milióny fragmentov súčasne na jeden cyklus.

Aké presné je Sangerovo sekvenovanie?

Sangerove sekvenovanie s 99,99% presnosť je „zlatým štandardom“klinického výskumu sekvenovanie . Novšie technológie NGS sa však stávajú bežnými aj v klinických výskumných laboratóriách kvôli ich vyššej priepustnosti a nižším nákladom na vzorku.

Odporúča: