Aké presné je Sangerovo sekvenovanie?

2024 Autor: Stanley Ellington | [email protected]. Naposledy zmenené: 2023-12-16 00:22

Sangerove sekvenovanie s 99,99% presnosť je „zlatým štandardom“klinického výskumu sekvenovanie . Novšie technológie NGS sa však stávajú bežnými aj v laboratóriách klinického výskumu kvôli ich vyššej priepustnosti a nižším nákladom na vzorku.

Tiež sa pýtali, prečo je NGS lepší ako Sanger?

Sanger sekvenovanie môže sekvenovať iba jeden fragment naraz. Pretože NGS využíva prietokové bunky, ktoré dokážu viazať milióny kúskov DNA, NGS dokáže čítať všetky tieto sekvencie súčasne. Vďaka tejto vysokovýkonnej funkcii je veľmi nákladovo efektívny pri sekvenovaní veľkého množstva DNA.

Navyše, aký je zmysel Sangerovho sekvenovania? Sangerove sekvenovanie je proces selektívnej inkorporácie dideoxynukleotidov ukončujúcich reťazec pomocou DNA polymerázy počas in vitro replikácie DNA; je to najpoužívanejšia metóda na detekciu SNV.

Následne si možno položiť otázku, aký je rozdiel medzi Sangerovým sekvenovaním a sekvenovaním novej generácie?

Ďalšie - generačné sekvenovanie (NGS) technológie sú podobné. Kritické rozdiel medzi Sangerovým sekvenovaním a NGS je sekvenovanie objem. Kým Sanger iba metódou sekvencie jeden fragment DNA naraz, NGS je masívne paralelný, sekvenovanie milióny fragmentov súčasne na jeden cyklus.

Ako funguje sekvenovanie ukončenia reťazca?

Sangerova DNA sekvenovanie je tiež známy ako reťaz - ukončenie metóda sekvenovanie . Výsledkom ddNTP je ukončenie reťazca DNA, pretože ddNTP nemá 3'-OH skupinu potrebnú na tvorbu fosfodiesterovej väzby medzi nukleotidmi. Bez tohto zväzku by reťaz nukleotidov, ktoré sa tvoria, je ukončené.