Prečo používame Sangerovo sekvenovanie?
Prečo používame Sangerovo sekvenovanie?

Video: Prečo používame Sangerovo sekvenovanie?

Video: Prečo používame Sangerovo sekvenovanie?
Video: Nová posila odborného tímu pre pôdohospodárstvo a životné prostredie Ján Kuchárik 2024, November
Anonim

Sangerove sekvenovanie je efektívny prístup pre skríningové štúdie variantov, keď je celkový počet vzoriek nízky. Pre variantné skríningové štúdie, kde je počet vzoriek vysoký, amplikón sekvenovanie s NGS je efektívnejšie a nákladovo efektívnejšie.

Podobne sa môžete opýtať, aký je účel Sangerovho sekvenovania?

Sangerove sekvenovanie je proces selektívnej inkorporácie dideoxynukleotidov ukončujúcich reťazec pomocou DNA polymerázy počas in vitro replikácie DNA; je to najpoužívanejšia metóda na detekciu SNV.

Tiež viete, prečo sa ddNTP používajú v Sangerovom sekvenovaní? dideoxynukleotidy sú inhibítory predlžovania reťazca DNA polymeráza, použité v Sanger metóda pre Sekvenovanie DNA . Tieto molekuly teda tvoria základ dideoxy metódy ukončenia reťazca Sekvenovanie DNA , o ktorom informoval Frederick Sanger a jeho tím v roku 1977 ako rozšírenie predchádzajúcej práce.

Tiež sa pýtali, prečo je NGS lepší ako Sanger?

Sanger sekvenovanie môže sekvenovať iba jeden fragment naraz. Pretože NGS využíva prietokové bunky, ktoré dokážu viazať milióny kúskov DNA, NGS dokáže čítať všetky tieto sekvencie súčasne. Vďaka tejto vysokovýkonnej funkcii je veľmi nákladovo efektívny pri sekvenovaní veľkého množstva DNA.

Čo potrebujete na sekvenovanie podľa Sangera?

Ingrediencie pre Sangerove sekvenovanie Patria medzi ne: A DNA polymerázový enzým. Primer, čo je krátky kus jednovláknového vlákna DNA ktorý sa viaže na šablónu DNA a pôsobí ako "štartér" pre polymerázu. Štvorka DNA nukleotidy (dATP, dTTP, dCTP, dGTP)

Odporúča: